การเปรียบเทียบตัวอย่างคู่จากผู้ป่วยมะเร็งกระเพาะที่ยังไม่รักษาและกลุ่มควบคุมพบการปัดเยื่อบุให้ richness และ diversity สูงกว่า biopsy อย่างมีนัยสำคัญ ในตัวอย่าง brushing กลุ่มมะเร็งมีความหลากหลายน้อยลงและองค์ประกอบต่างจากควบคุม ขณะที่ biopsy ไม่พบความต่างดังกล่าว ผลชี้ว่าวิธีเก็บตัวอย่างกำหนดสัญญาณ microbiome แต่ยังไม่พิสูจน์ว่าจุลชีพทำให้เกิดมะเร็งหรือใช้วินิจฉัยได้
ข้อค้นพบสำคัญ
- brushing เทียบ biopsy มี genus richness 60±46.5 กับ 25.5±19.5, Shannon 3.45±0.71 กับ 2.80±0.79 และ Simpson 0.95±0.03 กับ 0.92±0.06 (ทุกค่า p
ทำไมจึงมีความสำคัญระดับโลก
มาตรฐานการเก็บตัวอย่างเป็นปัญหาหลักของ microbiome ทั่วโลก งานนี้แสดงว่าความไวของวิธีอาจอธิบายผลที่ไม่สอดคล้องระหว่างการศึกษาและช่วยออกแบบ consortium มะเร็งกระเพาะ
บทบาทของนักวิจัยไทย
จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัยและโรงพยาบาลจุฬาลงกรณ์ใช้ตัวอย่างคู่จากผู้ป่วยไทยเพื่อแยกผลของโรคออกจากผลของวิธีเก็บในคนเดียวกัน
ข้อจำกัดที่ควรรู้
บทคัดย่อไม่ระบุจำนวนผู้เข้าร่วม อาหาร ยา PPI/ยาปฏิชีวนะ H. pylori ตำแหน่งก้อน และการปนเปื้อนช่องปาก 16S ให้ความละเอียดเชิงหน้าที่จำกัด ความต่างเป็นความสัมพันธ์ และ R² ของ beta diversity มีขนาดเล็ก