ทีมที่มีนักวิจัยโรงพยาบาลจุฬาภรณ์ขุดข้อมูล TCGA หา immune-related genes ใน lung squamous cell carcinoma แล้วตรวจใน GEO และ immunohistochemistry จาก candidate สี่ตัว AP1S2 ให้แนวโน้มไม่ตรงและ CLEC10A ไม่ต่างระหว่างเนื้องอกกับข้างเคียง ส่วน FBXO2 กับ IQGAP2 สอดคล้องกับ overall survival มากกว่า
ข้อค้นพบสำคัญ
- พบ 517 immune-score DEGs, 21 สัมพันธ์ OS และสี่ผ่าน GEO แต่ IHC ลด candidate ที่สอดคล้องเหลือ FBXO2/IQGAP2 เด่นกว่า immune score เองสัมพันธ์ OS แบบอิสระ
ทำไมจึงมีความสำคัญระดับโลก
การคัด biomarker หลายชั้นช่วยลด false discovery แต่ยังต้องมี prospective cohort, assay cutoff และ incremental value เหนือ stage ก่อนเป็นชุดตรวจ
บทบาทของนักวิจัยไทย
Pawin Pongkorpsakol จากโรงพยาบาลจุฬาภรณ์ร่วมงาน translational cancer biomarker
ข้อจำกัดที่ควรรู้
public retrospective datasets, batch effects, multiple testing และ cohort composition เสี่ยง overfitting IHC ไม่สอดคล้องสองในสี่ candidate แสดงความไม่แน่นอน ไม่มี clinical utility analysis
ตรวจสอบแหล่งต้นทาง
iNew MedicineiNew Medicine↗DOI: 10.1002/inm3.70047